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Dans une optique d'évaluation de l'état phytosanitaire de la culture d'agrumes en Tunisie, un dépistage des viroďdes infectant cette espčce fruitičre dans un parc ŕ bois de la profession a été effectué. Des méthodes de diagnostic, essentiellement moléculaires ont été utilisées et développées pour la détection de certains viroďdes infectant les agrumes. Sur le plan fondamental et pour caractériser les isolats Tunisiens de ces pathogčnes nous avons opté pour l'analyse de leur génome. Pour cela, nous avons synthétisé de l'ADNc correspondant ŕ plusieurs viroďdes infectant les agrumes et la vigne, par transcription réverse suivie par une amplification enzymatique (RT-PCR). L'ADNc obtenu a été cloné et séquencé. Les viroďdes des agrumes étudiés sont le CEVd, le HSVd et le CVd-III et pour la vigne les viroďdes étudiés sont l'AGVd et le GYSVd-1. Ces pathogčnes ont été choisis pour l'intéręt agronomique et biologique qu'il présentent. Les viroďdes séquencés ont été également utilisés dans cette étude pour établir des relations taxonomiques avec les séquences de viroďdes décrits dans les banques de données, ce qui a permis leur classification.