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Alignements Locaux Par Programmation Lin aire En Nombres Entiers

Sprache FranzösischFranzösisch
Buch Broschur
Buch Alignements Locaux Par Programmation Lin aire En Nombres Entiers Guillaume Collet
Libristo-Code: 06903984
Verlag Omniscriptum, Februar 2018
Détecter des similarités et des homologies entre protéines est une étape cruciale du processus d... Vollständige Beschreibung
? points 155 b
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Détecter des similarités et des homologies entre protéines est une étape cruciale du processus d'annotation des génomes. Afin de détecter des homologies, les alignements de séquences, globaux ou locaux, sont couramment utilisés. Néanmoins, dans la "zone d'ombre", nous devons utiliser les méthodes de reconnaissance de repliements. Dans ce domaine, le problčme du "Protein Threading" (PTP) utilise des paramčtres pairés pour aligner globalement une séquence de protéine avec une structure de protéine. Ŕ notre connaissance, il n'existe pas de méthode d'alignement local utilisant des paramčtres pairés. Ŕ partir du PTP, nous proposons cinq modélisations mathématiques de ces alignements locaux qui ont été implémentées et testées grâce au logiciel CPLEX 10.0. Nous avons ensuite développé un algorithme dédié permettant de résoudre un de ces modčles. Cet algorithme utilise des techniques connues en recherche opérationnelle: la séparation-évaluation, la descente de sous-gradient et la relaxation lagrangienne. Bien que les alignements locaux soient d'une plus grande complexité, nous montrons qu'ils sont réalisables et qu'ils améliorent la qualité des alignements.

Informationen zum Buch

Vollständiger Name Alignements Locaux Par Programmation Lin aire En Nombres Entiers
Sprache Französisch
Einband Buch - Broschur
Datum der Veröffentlichung 2018
Anzahl der Seiten 108
EAN 9786131532474
ISBN 6131532478
Libristo-Code 06903984
Verlag Omniscriptum
Gewicht 168
Abmessungen 152 x 229 x 7
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